In vielen Fällen verursacht die Giardiasis keine Symptome. Bei Kindern und bei Personen, die wenig Magensäure bilden, kommt es zu einem massiven Befall der Dünndarmschleimhaut. Folgende Symptome sind dann typisch für die Giardien-Infektion:

• Übelkeit und Erbrechen
• Kolikartige Bauchschmerzen
• Mäßiger, oft schaumiger Durchfall, eventuell mit Blutbeimengungen
• Blähungen
• Wasseransammlung im Gewebe (Ödeme, in langwierigen Fällen)
• In schweren Fällen Mangelernährung, da zu wenig Nährstoffe über den Darm aufgenommen werden

Die Inkubationszeit (Zeit zwischen Ansteckung und Ausbruch der Erkrankung) beträgt drei bis 25 Tage, selten auch länger.